yFiles를 이용한 miRNA-TF Regulation Network의 그래프 가시화

제목 : yFiles를 이용한 miRNA-TF Regulation Network의 그래프 가시화

저자 : 김선영

요약 :
microRNA(miRNA) 는 유전자 발현 조절에 관여하는 단백질로 번역되지 않는 기능 RNA 분자
의 일부이다. miRNA의 상단부 조절인자 역할을 하는 TF(Transcription factor)에 의해 miRNA
가 잘못된 조절을 수행하면 질병을 유발할 수 있어 TF-miRNA regulation은 중요한 측면으로
인지되고 있으나 현재 식물분야에서 이를 다루는 DB는 존재하지 않는다. 본 연구실에서 진행
중인 TF-miRNA regulation DB 구축을 완료하면 식물의 생장, 발달단계, 외부자극에 관여하는
유전자 및 매커니즘에 관심있는 생물학자들이 TF-miRNA regulator와 연관된 기작들을 한 눈에
이해할 수 있도록 이를 시각화하여 나타내는 것이 필요하다. 따라서 본 보고서에서는 TF-miRNA
regulation network를 그래프로 가시화하기 위해 Extensive Java Class Library인 yFiles를 이용
하여 시각화하는 방법에 대해 설명한다. TF-miRNA relation 데이터는 아직 구축되지 않은 DB
를 대신해 TestDataSet 파일을 사용하였다.

Keywords : TF-miRNA regulation network, yFiles, graph visualization

첨부파일 :

SYS201005_yFiles를 이용한 miRNA-TF Regulation Network.pdf